La méditation joue un rôle important dans la pratique de la méthode de l'Énergie Universelle. Quand une personne est en profonde méditation, la fréquence de ses d'ondes cérébrales passent de 60-80 hertz à moins de 15 hertz, voire même 8 hertz. La personne qui a ses chakras ouverts, peut atteindre un profond état de méditation qui permet de réduire facilement et rapidement la fréquence des ondes cérébrales.
Les étudiants qui utilisent d'autres méthodes de méditation, doivent passer plusieurs heures par jour à méditer ou à pratiquer. La méthode de l'Énergie Universelle ne requiert qu'une courte période de méditation. Cependant, l'École de l'Énergie Universelle encourage les praticiens à prendre du temps pour aider les autres plutôt que de méditer pendant de nombreuses heures par jour.